تربیت بدنی دانشگاه بینالمللی امام خمینی (ره) زیر نظر معاونت دانشجویی فعالیت میکند. از نظر سازمانی توسط یک مدیر، یک معاون، کارشناسان و مسوولین تأسیسات و اماکن ورزشی اداره میشود.
تربیت بدنی دانشگاه در دو قسمت خواهران و برادران فعالیت میکند.
برادران در رشتههای فوتبال، والیبال کشتی تکواندو کاراته هندبال فوتسال بسکتبال دو ومیدانی تنیس روی میز، جودو، بدنسازی، بدمینتون و ... در قسمت خواهران در رشتههای فوتسال، هندبال، والیبال، بسکتبال، آمادگی جسمانی، کاراته، دو و میدانی، بدمینتون، تنیس روی میز، شنا، ایروبیک و... فعالیت مینمایند.
هر کدام از رشتههای فوق دارای یک نفر دانشجو به عنوان دبیر انجمن مربوطه هستند که زیر نظر کارشناسان فوق برنامه برادران و خواهران جهت گسترش و پویایی وزرش دانشجویی انجام وظیفه مینمایندو در مسابقات داخل استان ، منطقه ای و مسابقات کشوری حضور فعال دارند. همچنین اجرای ورزش های همگانی شامل برگزاری جشنواره های ورزش همگانی، اجرای برنامه های گلگشت و کوهنوردی عمومی و حضور در مسابقات ورزشی ورزش های همگانی داخل استان، منطقه ای و کشوری.